يعتبر متحف تأريخ الهولوكوست هو القلب من مؤسسة "ياد فاشيم". ويقدم المتحف رواية الهولوكوست بالترتيب الزمني بدءا بنشوء السياسة النازية المناهضة لليهود مرورا باضطهاد اليهود من خلال مختلف المراسيم المجحفة وفرض القيود عليهم وتجميعهم في الغيتوات وانتهاءا بقتلهم جماعيا في إطار "الحل النهائي". وتعكس فضاءات العرض اهتماما خاصا بموضوع رد الفعل اليهودي إبان الهولوكوست، حيث يتم العرض من خلال الصور والمواد والوثائق التأريخية وعروض الصوت والضوء.